Обязанности и достижения:
Руководитель отдела биоинформатики (главный биоинформатик)
Планирование, координация и контроль деятельности подразделения в рамках реализации проектов геномной селекции холдинга и при разработке новых продуктов для внешних заказчиков. Формулировка задач для взаимодействия с и научными организациями.
Подготовка бюджета, контроль за исполнением.
Взаимодействие с подрядчиками - формирование технических заданий, переговоры в рамках проведения тендера, контроль сроков и качества работы.
Разработка методов и протоколов анализа геномных данных.
Выполнение поручений руководства АПХ.
Результаты:
Участие в разработке программы селекции, учитывающей производственные потребности АПХ и сохранения геномного разнообразия.
Разработана с нуля и внедрена автоматизированная система контроля качества генотипов, база данных для их хранения и записи результатов анализа.
Разработаны собственные инструменты для высокопроизводительного поиска близких родственников на основе SNP генотипов и определения значимых моногенных признаков.
Проведен поиск популяционных «инфлюенсеров» и определение животных для WGS.
Подготовлены и апробированы модели оценки селекционной ценности животных по более чем 20 признакам, с учетом параметров внешней среды.
Проведена работа по оптимизации «содержания» микрочипа Illumina Bovine SNP50, с которым работает компания.
Разработаны подходы к популяционно-генетическому анализу, оптимизирующему селекцию в стадах заказчика.
Проведена аннотация чипов и оптимизация контента для генотипирования с учётом возможности детекции моногенных признаков.